Một điểm yếu của Windows Phone được nhắc đi nhắc lại trong các bài đánh giá hoặc khi so sánh với nền tảng Android và iOS là số lượng ứng dụng nghèo nàn.
Trong nỗ lực rút ngắn khoảng cách về ứng dụng đối với Android và iOS, Microsoft nhiều khả năng sẽ chấp nhận các ứng dụng Android chạy trên nền tảng Windows 10 vào năm sau.
Một cuộc khảo sát mới đây từ các nhà phát triển ứng dụng Windows Phone đã cho thấy độ khó khăn cũng như sự vất vả của các nhà phát triển trên nền tảng non trẻ này.